Mac OS a tendance à laisser des fichiers un peu partout dans les répertoires auxquels il a accès en écriture.
Pour les supprimer, sous Windows :

cd /d X:\infected\folder
del /s /q /f /a .DS_STORE
del /s /q /f /a:h ._.*
del /s /q /f /a:h ._* # cela peut suprrimer aussi certains fichiers de chrome, attention s'il y'a un profil dans le chemin !
del /s /q /f /a __MACOSX

Le /a permet de matcher quels que soient les attributs.

Sous linux :

find ./ \( -name ".AppleDouble" -o -name .DS_Store -o -name ._.* \) -exec rm -Rf {} \;