Une partition ntfs contient un métafichier $BadClus qui contient une liste (logicielle) des secteurs marqués comme défectueux.
Suite à une duplication d’un disque vers un disque sain, j’ai retrouvé un système fonctionnel. Toutefois il était impossible d’effectuer une quelconque opération sur cette partition avec Gparted, à cause de cette liste de secteurs.

Il est possible, sous Windows, d’utiliser la commande chkdsk /B C: qui va relire l’intégralité du disque et marquer les secteurs comme non-defectueux s’ils sont lisibles. Mais c’est long…

On peut donc aussi utiliser la commande Linux ntfsfix -b -d /dev/sdX1 pour simplement supprimer cette liste de secteurs. Après un double redémarrage sous Windows, la partition était tout à fait manipulable par Gparted !