Il m’est arrivé d’avoir un fichier mp3 sur lequel vlc me sortait des tags qui n’étaient pas du tout ceux mentinnés par id3v2.
Après analyse du fichier, j’ai vu qu’il s’agissait de tags Monkey’s Audio (APE tags).

Pour les gérer sous Linux, j’ai trouvé le logiciel apetag (qui n’est pas dans les dépôts Debian).

git clone https://github.com/robertmuth/apetag
make
qui nous donne l’éxécutable apetag (que l’on peut éventuellement mettre dans /usr/local/bin pour l’avoir dans le $PATH).

Usage pour supprimer les tags

apetag -m erase -i file.mp3

Pour plusieurs fichiers à la fois, il me semble que la wildcard ne fonctionne pas, donc avec find :
find ./ -iname "*.mp3" -exec apetag -m erase -i {} \;