Concerne “Teams New”, le classique ayant été abandonné par MS.

https://learn.microsoft.com/en-us/answers/questions/5533409/starting-new-teams-for-all-users-automatically

Peut être désactivé par les modèles d’administration Teams (ADMX) ; toutefois, ceci ne s’applique que si l’utilisateur n’a jamais lancé Teams sur ce poste !
Config utilisateur -> Modèles d'administration -> Microsoft Teams -> Empêcher le démarrage automatique de Microsoft Teams après l’installation
à passer à “Activé”.

Sinon, peut être défini par une valeur de registre :
HKCU\Software\Classes\Local Settings\Software\Microsoft\Windows\CurrentVersion\AppModel\SystemAppData\MSTeams_8wekyb3d8bbwe\TeamsTfwStartupTask
Valeur State de type DWORD : 0

Ceci désactive le démarrage auto, autant dans les paramètres de Teams, que dans les paramètres Windows -> Applis au démarrage.